Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms