Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM4Q9C037 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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