Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD8-234ENST00000641503 1082 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049636.1-201ENST00000455736 1357 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCRL2-203ENST00000400880 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms