Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms