Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5RAP2Q96SN8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5RAP2Q96SN8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms