Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms