Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMYD4Q8IYR2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMYD4Q8IYR2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms