Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms