Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CATSPER4Q7RTX7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms