Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCBE1Q6UXH8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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