Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms