Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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