Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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