Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL19A1Q14993 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms