Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL1Q13616 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL1Q13616 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL1Q13616 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL1Q13616 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL1Q13616 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL1Q13616 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL1Q13616 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL1Q13616 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL1Q13616 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms