Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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