Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms