Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms