Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms