Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC023194.3-201ENST00000522679 277 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC02291-201ENST00000355909 1670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC02499-203ENST00000508147 455 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC103739.2-201ENST00000559839 807 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZFP14-202ENST00000589280 642 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms