Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms