Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX1P83916 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms