Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms