Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms