Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms