Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms