Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-EP13747 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms