Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GLI4P10075 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GLI4P10075 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GLI4P10075 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms