Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms