Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms