Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRPO00591 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRPO00591 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms