Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms