Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms