Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
XCL2Q9UBD3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms