Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFIP11Q9UBB9 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFIP11Q9UBB9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms