Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms