Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms