Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms