Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms