Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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