Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPHKAPQ2M3C7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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