Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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