Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms