Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms