Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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