Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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AP3B2Q13367 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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AP3B2Q13367 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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AP3B2Q13367 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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AP3B2Q13367 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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AP3B2Q13367 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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