Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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