Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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