Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms