Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HADHBP55084 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HADHBP55084 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HADHBP55084 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HADHBP55084 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HADHBP55084 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HADHBP55084 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms